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彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有图有真相)

外显子、内含子、mRNA、CDS、ORF区别详解_百度文库

名词解释


  • 靶基因
    • 即目的基因。在分子遗传中,它不仅要具有识别结合功能,还应该具有与位点结合后能表达你所需要的相应功能的作用。
    • 顺式靶基因:根据基因的位置关系预测. 反式靶基因:预测软件:LncTar,lncpro等
    • 顺势作用原件作用位点.(顺式作用位点):只影响处于同一DNA分子上的DNA序列,此性质通常暗示该位点不编码蛋白质.
    • 反式作用因子:指和顺式作用元件结合的可扩散性蛋白,包括基础因子,上游因子,诱导因子.
  • 丰度
    • 基因表达的丰度
      • 是指基因转录成mRNA的数量。
      • 基因表达丰度高是指该基因转录成mRNA多,那么表达的蛋白也多,对于表型的影响就大。
    • 基因丰度
      • 是指基因组中该基因的拷贝数量。
      • 基因丰度高,即这个基因的数量多,那么可能这个基因的表达量也会多,但是不一定,主要还是要看该基因的启动子强弱。所以基因丰度高不代表表达丰度也高。
  • 开放阅读框
    • 在分子生物学中,开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能,一段无终止密码子打断的碱基序列。
  • UTR
    • untranslational region,指的是mRNA上5‘或3’端的非翻译区
  • 关于编码区和非编码区
    • 编 码区就是一段要表达的DNA序列,而非编码区的则不被表达,外显子和内含子是存在于真核细胞中,顾名思义外显子就是要表达的,内含子是不被表达,它们一般 存在于一段基因中,一般间隔排列。总的来说就是,基因分为编码区和非编码区,而在真核细胞中编码区又有外显子和内含子。
  • 引物
    • 在 DNA的复制过程中需要有一段很小的核苷酸序列来引导另一条链的合成,它就是引物,我可以简单说一下为什么要有引物,来便于你理解,因为DNA在复制过程 中并不是由一种DNA聚合酶来完成的,我们一般所指的NDA聚合酶就是可以结合在引物上来进行核苷酸的链接,它的速度比较快,也有用来合成引物的聚合酶, 但是他的速度很慢,所以就要把它们的优点集合起来就有了引物这个东西。
  • 生物标志物
    • (Biomarker)是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变或可能发生的改变的生化指标,具有非常广泛的用途。生物标志物可用于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。
  • 转录水平调控
    • 是真核基因表达调控的重要环节。根据真核基因表达是否受环境影响可分为:发育调控和瞬时调控。其中发育调控是指真核生物为确保自身生长、发育、分化等对基因表达按“预定”和“有序”的程序进行的调控,是不可逆的过程;瞬时调控是指真核生物在内、外环境的刺激下所做出的适应性转录调控,是可逆过程。
  • 转录后调控(post-transcriptional control)
    • 真核生物基因活性可以在转录水平上调控,也可以在转录后对RNA的加工进行调控,即转录后调控。
    • 包 括:(1)刚转录的核内不均一RNA ( hnRNA)的选择性加工。运输到细胞质中翻译。如海胆的成体肠细胞中,在2500种hnRNA中只有300种形成mRNA; (2)选择性剪接,即同一其因转录出的RNA通过mRNA前提的选择性拼接产生不同成熟 mRNA,转录后翻译成不同的蛋白质。
  • 生物分类
    • 分类等级包括域(总界)、界、门、纲、目、科、属、种。在每一级里,都可插入一个亚级。
    • 详细分类
      • 域、界、门、亚门、总纲、纲、亚纲、总目、目、亚目、总科、科、亚科、总属、属、亚属、总种、种、亚种。
      • 三域系统生物分类
        • 真核域
          • 动物界、真菌界、变形虫界、植物界、有孔虫界
        • 细菌域
          • 原核生物界
        • 古菌域
          • 嗜泉古菌界、广域古菌界、初生古菌界[2]
      • 按大小分
        • 生物由原核生物、真核生物及非细胞生物组成,包括动物、植物、细菌、真菌、病毒等,其特征是可以进行新陈代谢。
        • 动物
        • 植物
        • 微生物
  • 微生物
    • (个体难以用肉眼观察的一切微小生物)
    • 微 生物包括:细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体,它个体微小,与人类关系密切。涵盖了有益跟有害的众多种类,广泛涉 及食品、医药、工农业、环保等诸多领域。在中国大陆地区的教科书中,均将微生物划分为以下8大类:细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次体、支原体、衣原体、 螺旋体。有些微生物是肉眼可以看见的,像属于真菌的蘑菇、灵芝等。还有微生物是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”,但是它的生存必须 依赖于活细胞。
  • 套索结构
    • 通过分析体外剪接反应中形成的中间体,发现内含子是以一种套索结构(lariat structure )的形式被切除的,即内含子5’端的鸟苷酸依靠2’,5’-磷酸二酯键与靠近内含子3’末端的一个腺苷酸连接在一起。
  • 融合基因
    • 是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增 强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。

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