SRA toolkit的安装

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下载 SRA toolkit

输入指令 w![](/media/editor/TIM20181221213537_20181221215314840960.png)get https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.9.2/sratoolkit.2.9.2-ubuntu64.tar.gz 显示 确认输入地址无误,未分析出具体原因,改用浏览器下载 下载地址 下载文件“sratoolkit.2.9.2-ubuntu64.tar.gz”

解压

输入指令 tar zvxf sratoolkit.2.9.2-ubuntu64.tar.gz -C ~/Biosofts/

配置环境变量

输入指令 echo 'export PATH=~/Biosofts/sratoolkit.2.9.2-ubuntu64/bin:$PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc

使用

命令prefetch 可以从远程站点下载文件 prefetch -h 预览


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